Abbiamo impiegato le pinzette ottiche per caratterizzare traiettorie di denaturazione e rinaturazione di singole molecole di T4 lisozima. Abbiamo utilizzato diverse geometrie di distendimento per studiare il folding di regioni diverse della proteina ed applicato il teorema di fluttuazione di Crooks per estrarre energie libere di denaturazione. I risultati di questi studi mostrano come la topologia possa influire sulle traiettorie di denaturazione e rinaturazione di una proteina.