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Stefano Luccioli |
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CNR ISC e INFN Firenze |
Abstract
In questo seminario e' presentata la ricostruzione del panorama di energia libera di un modello di proteina in funzione di una coordinata interna del sistema. Il problema viene affrontato con due metodi indipendenti: da una parte utilizzando una versione estesa dell'eguaglianza di Jarzynski che lega l'energia libera al lavoro fatto sul sistema durante un esperimento di manipolazione; dall'altra attraverso una analisi delle "strutture inerenti" del sistema, ossia i minimi locali dell'energia potenziale. In un intervallo di temperature prossimo alla transizione di "folding" della proteina si trova un buon accordo quantitativo tra le energie libere ottenute mediante i due approcci. I due metodi risultano quindi consistenti e capaci di riprodurre le proprieta' di equilibrio del sistema esaminato.