BARBARA COLUZZI


Due self-avoiding walks interagenti,
un modello semplificato per la denaturazione del DNA

Autori: Maria Serena Causo, Barbara Coluzzi e Peter Grassberger

Si presentano i risultati numerici su alcuni modelli di due self-avoiding walks (SAWs) interagenti, con origine in comune su un reticolo cubico, per diverse scelte del tipo di interazione.

Si considera anzitutto il caso di interazione on-site attrattiva tra ogni monomero della catena $a$ ed ogni monomero della catena $b$ che occupano uno stesso sito del reticolo. Il modello \`e equivalente alla media annealed sul disordine di un SAW su reticolo disordinato.

Nell'altro caso studiato in particolare, l'interazione \`e on-site attrattiva solo tra monomeri che hanno le stesse posizioni nelle rispettive catene, mentre i monomeri che hanno posizioni differenti non possono occupare uno stesso sito del reticolo.
Quest'ultima situazione richiama un modello proposto gi\`a negli anni '60 da Poland e Scheraga , per lo studio della denaturazione del DNA, che pu\`o essere risolto analiticamente trascurando in parte l'effetto della self-avoidance. I risultati numerici vengono confrontati con le previsioni analitiche e con i risultati ottenibili per random walks interagenti, modello esattamente risolvibile analiticamente.

Le simulazioni sono state effettuate utilizzando il pruned-enriched Rosenbluth method (PERM), un algoritmo proposto recentemente, particolarmente adatto a questo tipo di studi numerici, che viene discusso in dettaglio.